Hola Anderson, intentare explicar la que necesitas hacer:

• Para sincronizar los dominios de tu actual proveedor con tu WHMCS, deberias ser revendedor de dominios de ese proveedor y tener conexión de tu WHMCS con el sistema de aprovisionamiento de dicho proveedor.
• Si no es el caso, necesitas transferir los dominios de tu actual proveedor a tu registrador donde revendas dominios. Eso obviamente implica pagar el costo de transferencia.
• Te sugeriria que vayas transfiriendo uno a uno conforme se acercan a la fecha de vencimiento. Mientras tanto en tu WHMCS en la sección de registradores puedes activar el registrador EMAIL con el que puedes configurar tus dominios en tu WHMCS y darles a tus clientes la opcion de ver el dominio en sus areas de cliente y «gestionarlos».
• Puedes ir creando a tus clientes actuales e ir vinculando las cuentas de hosting que estan en tu WHM y los dominios, todo de forma manual. Este proceso es complicado de explicar, pero en el ultimo webinar privado que tuvimos lo explique, te comparto la sección del video en cuestion: https://nodored.com/foros/lessons/importar-una-cuenta-existente-en-whm-a-whmcs/

Espero haber resuelto tu pregunta.